Benedict Cumberbatch được biết đến là ngôi sao khá kín tiếng về đời tư và ít scandal. Trong khi còn ở KwaZulu-Natal, Nam Phi vào năm 2005, Cumberbatch và hai người bạn bị bắt cóc qua đêm và bị đe dọa bằng súng bởi một nhóm người địa phương. Cuối cùng những kẻ bắt cóc đã đẩy họ vào vùng lãnh thổ bất ổn chính trị và thả họ đi mà không một lời giải thích. Cumberbatch nói về sự việc: "Nó đã dạy tôi rằng bạn bước vào thế giới này cũng giống như bạn tự mình rời khỏi nó. Điều đó khiến tôi muốn sống một cuộc sống ít bình thường.". Anh tán thành với triết lý Phật giáo và bày tỏ sự hấp dẫn đối với thiền định và chánh niệm.

Cumberbatch kết hôn với đạo diễn nhà hát và opera Sophie Hunter. Lễ đính hôn của họ đã được công bố trong mục "Những cuộc Hôn nhân Sắp tới" của tạp chí The Times vào ngày 5 tháng 11 năm 2014, sau tình bạn 17 năm giữa hai người. Ngày 14 tháng 2 năm 2015, cặp vợ chồng kết hôn tại nhà thờ thế kỷ 12 Church of St. Peter and St. Paul trên đảo Isle of Wight nước Anh, sau đó đón tiếp khách mời tại Mottistone Manor. Họ hiện đã có với nhau một con trai tên là Christopher Carlton Cumberbatch.

Cumberbatch được phong tước Hiệp sĩ Hoàng gia Anh (CBE) vào sinh nhật của Nữ hoàng Anh năm 2015 cho sự cống hiến của anh vào các hoạt động nghệ thuật và từ thiện. Anh đã nhận được danh hiệu cao quý này từ Nữ hoàng Elizabeth II tại Lễ công bố nhậm chức tại cung điện Buckingham vào ngày 10 tháng 11 năm 2015. Tháng 2 năm 2016, Cumberbatch được bổ nhiệm làm thành viên khách mời tại Lady Margaret Hall, Đại học Oxford.